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【2025年】事業承継・M&A補助金のPMI推進枠など概要解説!

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【2025年】事業承継・M&A補助金のPMI推進枠など概要解説!

2025年最新の事業承継・M&A補助金の11次公募では、専門家活用枠のみが募集されました。PMI推進枠に申請したい場合は、12次以降の公募を待つ必要があります。本補助金を申請するときは、要件を満たすほか、採択率を高めるための方法なども把握しておくのが重要です。今回は本補助金に関して、2025年の最新情報や申請方法など、知っておきたい点をわかりやすく解説します。

2025年最新の事業承継・M&A補助金とは

事業承継補助金とはのイメージ

事業承継や事業再編などを促し、日本国の経済活性化を目的とするのが事業承継・M&A補助金です。本記事を執筆している時点では公募が締め切られており、今のところ次回の募集時期は未定です。

ここからは11次公募の情報などをもとに、本補助金の基本情報について紹介します。

関連記事:補助金活用で利用できる圧縮記帳とは?条件や方式・対象を解説!

関連記事:助成金と補助金の違いとは?知っておきたいポイントを解説

事業承継・M&Aにかかる費用を支援してもらえる制度

本補助金の活用によって、事業承継やM&Aなどを実施するとき、費用の負担を軽減できるのがメリットです。

一方で、以下の通り対象者が決まっていたり、審査があったりするため、しっかりと理解したうえで準備する必要があります。

公募の対象者

概要

日本国内に拠点or居住地があり、国内で事業を営んでいる

  • 外国籍の方の場合、国籍や在留期間など記載の住民票の添付が必要
  • 個人事業主の場合、開業届・青色申告承認申請書の提出から5年経過し、確定申告書・青色申告決算書のコピー提出が条件

暴力団など反社会的勢力以外である

資金提供など反社会的勢力との関係があるとみなされると対象外

事務局からの依頼に適切に対応する

  • 質問への回答や追加資料提出などを求められるケースがある
  • 結果通知などに関して、修正したうえで通知される可能性もある点への同意が必要

事務局の調査やアンケートなどに協力する

  • 申請時にアンケートへの回答が必要
  • 回答内容と採択の結果は無関係

法令遵守上の問題がクリーンである

問題があるとみなされると対象外

補助金の返還などが発生した場合、事務局へ補助金負担の要請が不可であることに同意する

どのような理由であれ、ペナルティなど補助金の交付で負担する費用について事務局は無関係である

補助金指定停止措置or指名停止措置の対象外である

経済産業省などから指名停止措置を受けている場合、対象外である

個人情報などのデータが利用されることへ同意する

  • 匿名性を確保しつつ公表されるケースがある
  • 補助金事務局などに情報が共有される

申請から過去18ヵ月間で賃上げ加点などの要件未達成の場合、やむを得ないケースを除き大幅に減点される

第8次公募以降の本補助金などが対象

FA・M&A仲介費用を対象経費とする場合、M&A支援機関登録制度事務局へ情報提供されることなどへ同意する

FAとはファイナンシャルアドバイザー

M&A支援機関登録制度に登録したFA・仲介業者などと、本補助金の対象者などが異なる

該当すると対象外

PMI推進枠の公募は次回以降に期待

今回の本補助金の公募では専門家活用枠のみであったため、PMI推進枠へ応募するには次回以降の公募を待つ必要があります。全体の補助予定件数は約1,800件で、11次公募での採択件数は359件と判明しています。

2026年度末までに3回ほど公募が予定されているため、最新の情報をチェックするとよいでしょう。

事業承継・M&A補助金の4つの枠

本補助金には4つの枠があり、具体的には以下の通りです。

  • PMI推進枠
  • 事業承継推進枠
  • 専門家活用枠
  • 廃業・再チャレンジ枠

4つの枠について、ここから詳しく解説します。

PMI推進枠

M&Aによって経営統合を進める中で、専門家費用や設備投資などの費用を支援してもらえるのが「PMI推進枠」です。PMIとは「Post Merger Integration」の略で、以下の3つによって構成されます。

  • 経営統合
  • 業務統合
  • 意識統合

上限や補助率など、具体的な内容は以下の表にまとめました。

上限

  • PMI専門家活用類型:150万円
  • 事業統合投資類型:800〜1,000万円

補助率

  • PMI専門家活用類型:2分の1
  • 事業統合投資類型:2分の1〜3分の2

対象

  • 設備費
  • 外注費
  • 委託費など

事業統合投資類型の場合、小規模事業者は補助率3分の2が適用されます。

事業承継推進枠

5年以内に、親族内承継か従業員承継を予定する事業者の支援を目的とするのが「事業承継推進枠」です。具体的な内容は以下の表の通りです。

上限

800〜1,000万円

補助率

2分の1〜3分の2

対象

  • 設備費
  • 産業財産権等関連経費
  • 謝金
  • 旅費
  • 外注費
  • 委託費など

一定の賃上げを実施すると、補助上限1,000万円が適用されます。小規模事業者に該当する場合、補助率は3分の2です。

専門家活用枠

事業再編するときなど、経営資源の引き継ぎに必要な経費の支援を目的とするのが「専門家活用枠」です。以下の通り、2つの類型に分類できるのが特徴です。

  • 買い手支援類型(Ⅰ型):経営資源を譲り受ける事業者を対象
  • 売り手支援類型(Ⅱ型):経営資源を譲り渡す事業者を対象

概要は以下の表にまとめました。

上限

  • 買い手支援類型:600〜800万円、2,000万円
  • 売り手支援類型:600〜800万円

補助率

  • 買い手支援類型:3分の1〜2分の1、3分の2
  • 売り手支援類型:2分の1〜3分の2

対象

  • 謝金
  • 旅費
  • 外注費
  • 委託費
  • システム利用料
  • 保険料

100億企業要件を満たすと、買い手支援類型の上限は2,000万円まで拡大されます。

一方で、今回の公募では対象外となったため、募集要領をよく確認する必要があります。

廃業・再チャレンジ枠

事業承継などにより廃業するとき、発生する費用の支援を目的とするのが「廃業・再チャレンジ枠」です。具体的な内容は、以下の表にまとめました。

上限

150万円

補助率

2分の1〜3分の2

対象

  • 産業支援費
  • 在庫廃棄費
  • 解体費
  • 原状回復費
  • リースの解約費
  • 移転・移設費用(他の枠と併用申請時)

事業承継促進枠などと併用する場合、補助上限額に150万円が上乗せされます。

事業承継・M&A補助金の申請方法

手続きに関するイメージ

本補助金を申請するときに知っておきたい内容として、以下の3点があげられます。

  • 必要書類
  • 具体的な手順
  • お問合せ先

それぞれについて、詳しく解説します。

必要書類

今回の本補助金を申請するとき、具体的に以下の書類の用意が求められます。

買い手支援類型(Ⅰ型):法人

  • 履歴事項全部証明書
  • 直近3期分の決算書
  • 常時雇用する従業員1人分の労働条件通知書

【法人の代表者】

住民票

買い手支援類型(Ⅰ型):個人事業主

  • 住民票
  • 直近3期分の確定申告書B第一表・第二表
  • 青色申告決算書
  • 開業届・青色申告承認申請書のコピー
  • 常時雇用する従業員1名の労働条件通知書

売り手支援類型(Ⅱ型)

【対象会社】

  • 履歴事項全部証明書
  • 確定申告書
  • 直近3期分の決算書
  • 株主名簿
  • 常時雇用する従業員1人分の労働条件通知書

【対象会社の代表】

住民票

【共同申請の支配株主or株主代表】

  • 支配株主が個人:住民票
  • 支配株主が法人:履歴事項全部証明書
  • 株主代表が個人:住民票・株主代表の確認書
  • 株主代表が法人:履歴事項全部証明書・株主代表の確認書

具体的な手順

本補助金では申請期間や補助事業実施期間などが決まっており、今回の場合、以下の流れで交付が決定します。

  1. 【3月31日】公募要領公開
  2. 【5月9日】受付開始
  3. 【6月6日】締め切り
  4. 【7月11日】採択者決定
  5. 【7月中旬】交付申請・交付決定
  6. 【2026年】補助事業完了・実績報告
  7. 【2026年】確定検査・補助金請求

原則として「jGrants」の利用による電子申請が必要なため、事前に「gBizIDプライム」のアカウント取得が求められます。アカウント取得には1週間から2週間ほど要するため、以下の4つを用意したうえで早めの手続きが望ましいです。

  • 印鑑証明書or印鑑登録証明書の原本
  • 法人代表者印or個人事業主の実印が押印してある申請書
  • メールアドレス
  • SMS受信できる電話番号

補助金が交付されたあとは、後年報告も義務付けられているため、適切に対応する必要があります。

お問い合せ先

手続きや要件など、本補助金について問い合せたい場合は、以下の通り事務局コールセンターを利用できます。

問い合せ先

概要

コールセンター

  • 電話番号:050-3145-3812
  • 受付時間:平日10時から12時・13時から17時

※土日祝日、年末年始休み

執筆時点では問い合せフォームが設けられていないため、公式サイトの「よくある質問」にアクセスし、答えをリサーチするのも1つの方法です。

参考:事業承継・M&A補助金

事業承継・M&A補助金の注意点

個人事業税がかからない業種のイメージ

本補助金の申請において注意したいのは、不正受給時のペナルティと、締め切り直前の申請集中による混雑です。それぞれの詳細については、以下の表にまとめました。

不正受給時のペナルティ

  • 不正が発覚すると、5年以下の懲役or100万円以下の罰金の対象※両方課せられる可能性もある
  • 交付済みの場合、全額返金に加えて年10.95%の利率の加算金を課される可能性がある

締め切り直前の混雑

  • 締め切り前日や当日、申請が集中する傾向にある
  • 書類などに不備がある場合、修正したうえで再度申請する時間がない
  • 採択の可能性を高めるための提案を求める場合、期日の5営業日前までに書類を提出するとよい

偽りの情報を記載したり添付したりすると、ペナルティを課せられるケースがあるため、よく理解しておく必要があります。

申請締め切り直前に申請すると、内容について修正する時間がないため、やむを得ず不採択となる可能性があります。なるべく早めに申請する方が、結果として採択の可能性を高めることにつながるでしょう。

参考:【公募要領】11次公募

関連記事:補助金・助成金に税金はかかる?税務上の取扱いと処理について

事業承継・M&A補助金の審査のポイント

本補助金を活用するには、要件や事業内容などについての審査に通る必要があるため、できる範囲で対策しておくとよいでしょう。審査の具体的な内容に関しては、以下の表にまとめました。

資格要件の審査

対象者、上限額などに適合するのかを審査

書面審査

提出された書類をもとに、以下の点を審査

  • 買い手支援類型(Ⅰ型):財務内容の健全性、買収の必要性など
  • 売り手支援類型(Ⅱ型):譲渡の目的と必要性など

加点事由

以下に該当する場合、証明書類を提出すると加点される

  • 申請時、地域未来牽引企業である
  • 申請時、法律で定める小規模企業者である
  • 申請時、事業継続力強化計画の認定を受けている
  • 状況報告時、事業内最低賃金を30円以上あげる予定があり、従業員に通知しているなど

加点事由を満たすと、本補助金の採択の可能性を高められます。

参考:【公募要領】11次公募

関連記事:補助金申請は税理士に相談したほうがいい?依頼のメリットやコストについて

補助金申請に関する相談は税理士へ

2025年最新の事業承継・M&A補助金の要件や申請方法、注意点などを解説しました。11次公募では専門家活用枠のみであったため、PMI推進枠を申請できるのは次回以降です。本補助金の申請では審査が実施されるため、事業計画など事前準備が重要です。

一方で、日々の業務で忙しい場合、補助金申請にかかる業務をするのが難しいケースもあるでしょう。

補助金申請の実績が豊富な税理士への依頼で、採択率が高まるため、かけた費用以上の効果が期待できます。

小谷野税理士事務所は、補助金や助成金の申請サポートを始め、豊富な実績があります。まずはお気軽に無料相談をご利用ください。

関連記事:【税理士監修】法人が税理士に依頼する費用の相場はいくら?依頼内容別の相場と費用を抑えるポイントをご紹介!

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この記事の監修者
池田 大吾小谷野税理士法人
カルフォルニア大学アーバイン校卒業、大手生命保険会社勤務を経て2007年小谷野税理士法人に入社。
会計、税務、経理実務の支援業務から各種補助金の相談・申請業務、企業及び個人のリスクマネジメントのコンサルタント業務を行う。
銀行はじめ多くの金融機関、会計・税務・財務業界に多くの人脈を持ち、企業財務のマルチアドバイザーとして活躍。
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